中国大连造船公司从芬兰瓦锡兰公司进口一批船用发动设备，由中国河北远洋运输公司的“天风”号轮承运。货物到达目的港天津新港后，经商检人员检查发现货物短量，且部分货物内在质量有一定的缺陷。货物运输保险合同中注明投保的是水渍险，对本案货物损失保险公司应作何处理?(