在一起工程纠纷中，A公司根据双方事前达成的仲裁协议向仲裁委员会提请仲裁，而B公司则认为仲裁协议无效，请求人民法院对仲裁协议的效力作出裁定。于是，A公司也请求仲裁委员会作出确认该仲裁协议有效的决定。那么，应当(　　)。