王某所在单位派其出国考察，在办理出国手续时才发现5年前申领的护照已经过期，王某遂通过其在公安局出入境管理处工作的好友张某补办了延期手续。 请根据《行政许可法》的规定分析下列问题： 公安部门对王某已经过期的护照应当如何处理？